La Cámara Navarra de Comercio e Industria, al igual que el resto de Cámaras españolas, obtiene sus recursos a través de dos vías fundamentales:

1. El Recurso Cameral Permanente
Es una tasa parafiscal que, a su vez, tiene su origen en tres impuestos:

• Impuesto de Actividades Económicas, en el caso de personas jurídicas que facturen más de 1millón de €.
  
• I.R.P.F., en el caso de personas físicas.
  
• Impuesto de Sociedades, en el caso de personas jurídicas.
  
De la cuota tributaria que empresas y autónomos abonan por dichos impuestos, se calcula un tanto por ciento que tiene como destinataria la Cámara para que ésta financie aquellas actividades ordinarias que posibiliten la defensa, promoción y representación de los intereses generales del comercio, la industria y los servicios de Navarra. El Recurso Cameral Permanente no puede suponer más de un 60% de los ingresos totales obtenidos por la organización. Sin embargo, en la Cámara Navarra no supera el 50%.
En el ejercicio 2009, el 36% de los miembros de la Cámara quedaron exentos del pago de dicha cuota. De los que pagaron, el 46,9% pagó una cantidad inferior a los 60 euros al año.

2. Recursos propios
Provienen de la prestación de servicios retribuidos a empresas, de la rentabilización del patrimonio cameral, de la firma de convenios de colaboración con Administraciones e instituciones, ejecución de proyectos, gestión de programas, etc. Estas partidas suponen un 60% de los ingresos totales de la Cámara.

El presupuesto anual elaborado por el Comité ejecutivo de la Cámara y aprobado por el Pleno, debe ser presentado para su aprobación por el Departamento de Innovación, Empresa y Empleo del Gobierno de Navarra, como órgano tutelante.